SSL证书是用于加密网站上的数据传输，防止数据被窃取和篡改。在申请SSL证书时，可以选择购买商业SSL证书或者自己生成自签名SSL证书，两种方式虽然都能实现加密，但还是有很大的区别。

1. 可信度不同

商业SSL证书由公认的证书颁发机构（CA）颁发，比如Symantec、GeoTrust、Comodo等，他们会验证证书申请者的身份和可信度。在用户访问网站时，浏览器会自动检查网站的证书是否来自受信任的CA，如果是，则会在地址栏显示一个绿色的锁形状，表示这是一个受信任的网站。而如果使用自签名证书，浏览器就无法验证其可信度，出现一条安全警告提示，可能会减少用户信任度。

2. 安全性不同

商业SSL证书的安全性比自签名证书更高，商业证书CA会对证书进行严格的验证，申请者需要提供公司相关信息、域名所有或控制权等证明资料，确保书使用者是真实存在的合法企业。而自签名证书则是自行颁发的，不存在身份验证和证明资料，因此可以被黑客轻易伪造，不具备足够的安全保障。

3. 成本不同

商业SSL证书需要购买，价格相对较高，根据不同品牌和类型，费用也有所不同，一般需要每年续费。而自签名证书则可以自行生成，不需要花费任何费用，但由于其可信度和安全性都不如商业证书，对网站的信誉和流量也会造成一定的损失。

在选择商业SSL证书或自签名SSL证书时，需要考虑实际的需求和预算。对于重要的商务网站和电子商务平台，建议使用商业SSL证书，以确保数据的安全性和用户的信任度。而对于内部网站或测试环境，则可以使用自签名证书，省去了费用开销，同时也无需过分注重安全保障。

总之，商业SSL证书和自签名SSL证书虽然都可以实现加密，但在可信度、安全性和成本等方面存在很大的区别。选择合适的证书类型，需要根据实际需要和预算进行权衡。